农业经济系在设立初期主要以课程建设和教材建设为主,最早开设的课程是农业经济学,后来又相继开设了社会主义农业企业组织、外国农业经济等课程。目前,农业经济系现面向本科生、硕士、博士研究生开设的主要课程有:农业经济学、农业经济专题、农业政策学等二十多门课程,其中《农业经济学》为自治区级本科精品课程。
在教材建设方面,由吴华宝主编了《社会主义农业企业组织》(1953年),朱西农编写了《农业经济学》(1957年),吴华宝、朱甸余等编写了《农业经济学》(1964年),朱甸余、陈飞明、陈和钧等编写了《农业经济》(1973年)。1979年陈飞明参加了《农业经济学》、黄翼参加了《外国农业经济》全国统编教材的编写工作。近年来,农业经济系主编了《农业经济管理学》等教材6部,参编教材8部。
在教学研究方面,主持自治区级教研课题1项,校级教研课题4项。有1名教师获自治区优秀教师称号,1名教师获校级十佳教学标兵称号。我系教师指导的学生两次在全国大学生“用友杯”沙盘模拟经营大赛中获新疆区总决赛一等奖,并获得了优秀指导教师奖。