在1952年建校之初，农经系设立了企业组织教研组，是建系设立的四个教研组之一。根据农业经济专业教育的需要，1960年更名为经营管理教研组，1978年定名为经营管理教研室，2003年经营管理教研室更名为管理系。
历任经营管理教研室（组）主任有：阮模教授(1952-1960)、唐志镛教授(1960-1962)、曹冯德教授(1962-1983)、张学勉教授(1983-1984)、周育群副教授(1984-1986)、胡嘉汉副教授（1987-1992）、刘维忠教授（1992-1996）、郭欣禹副教授（1997-1999）、牛刚教授（1999-2001），余国新副教授(2001-2003)。历任管理系主任：刘国勇副教授(2003-2005)、余国新副教授(2005-2006)、朱峰副教授（2006-2011）、热孜燕副教授(2011-至今)。
管理系阮模、唐志镛、曹冯德、易振国、李仁宗、张学勉、周育群、胡嘉汉等老一辈教授学者，为管理学科的建设和发展，特别是在队伍建设、课程建设、教材建设、教学改革等方面做出了突出的贡献，奠定了本学科发展基础。
